1．種子含蛋白質，脂肪，澱粉，氰苷（cyanophoric），維生素B2及多種氨基酸糖等。
2．外種皮含有毒成分白果酸（ginkgolic acid），氫化白果酸（hydroginkgolic acid），白果酚（ginkgol），白果醇（ginnol）。
3．肉質外種皮含白果酸（ginkgolic acid），氫化白果酸（hydroginkgolic acid），氫化白果亞酸（hhydroginkgolinic acid），銀杏二酚（bilobbol），白果醇（ginnol）和黃酮類化合物。赤黴素（gibberellin）和動力精樣（cytokinin－like）
4．種子含有毒成分4－O－methylpyridoxine），稱為銀杏毒素（ginkgotoxin）。
5．還含6－（8－十五碳烯基）－2，4－二羥基苯甲酸[6－（pentadec－8－enyl）－2,4－dihy－droxybenzoic acid]，6－十三烷基－2，4－二羥基苯甲酸（6－tridecy－2,4－dihydroxybenzoic acid），腰果酸（anacaridc acid）。