荊芥含揮發油1.8%,油中主要成分為右旋薄荷酮(d-menthone),消旋薄荷酮,少量成分為右旋檸檬烯(d-limonene)。揮發油中尚含有α-蒎烯(α-pinene)、莰烯(camphene)、β-蒎烯(β-pinene)、3-辛酮(3-octanone)、對聚傘花烯(p-cymene)、3-辛醇(3-octanol)、1-辛烯-3-醇(1-octen-3-ol)、異薄荷酮(isomenthone)、l-異薄荷酮(l-isomenthone)、3-甲基環己酮(3-methylcyclohexanone)、β-欖香烯(β-elemene)、石竹烯(caryophyllene)、β-葎草烯(β-humulene)、胡薄荷酮(pulegone)、異胡薄荷酮(isopulegone)、l-胡薄荷酮(l-pulegone)、胡椒酮(piperitone)、胡椒鹼烯酮(piperitenone)等。荊芥穗中分離出荊芥甙(schizonepetoside)A、B、C、D、E以及荊芥醇(schizonol)、荊芥二醇(schizonodiol)等單萜類化合物。亦分離出芹菜素-7-O-葡萄糖甙(apigenin-7-O-β-D-glucoside)、木犀草素-7-O-葡萄糖甙(luteolin-7-O-β-D-glucoside)、橙皮甙(hesperidin)、香葉木素(diosmetin)、橙皮素(hesperetin)和木犀草素(luteolin)等黃酮類成分。