1．抗菌作用:揮發油，特別是麝香草腦有防腐、消毒作用，可用於口腔、咽喉之滅菌。
2．驅蟲作用:麝香草腦對鉤蟲、鞭蟲有麻痺作用，但因其毒性較大，已為其他更好的驅蟲劑所取代。尚可用於治療球蟲病。
3．對呼吸道的作用:葉有祛痰作用。其萃取物能增進支氣管粘膜的分泌，麝香草腦、香荊芥酚能促進纖毛（蛙氣管）運動，並以原形自肺排出，故有殺菌作用，有人認為可用於治療氣管炎、百日咳。
4．興奮、鎮靜作用。
5．體內過程與毒性:麝香草腦在腸胃道可迅速而完全的被吸收；油、酒可促其吸收。半數在體內破壞，其餘部分與硫酸根或葡萄醣醛酸相結合而由尿排出。塗於皮膚無刺激性，亦不吸收，但能刺激粘膜，故可引起嘔吐，其毒性僅及酚的1／4。口服1克不致引起中毒癥狀，量大則可致眩暈、上腹劇痛、興奮、惡心及嘔吐、虛弱、流涎流汗、發紺、體溫降低、脈細數、呼吸慢乃至昏迷。
6．由於麝香草精油具有防菌功能而被用於調配漱口水、抗灰甲真菌藥和抗咳嗽或支氣管炎藥，不少消毒劑亦含有百里酚。在現代抗生素研發以前，麝香草精油會被用於製作塗藥繃帶。能做於殺菌、緩解痙孿、祛痰劑。有鎮定作用。嚼食麝香草則可以撫平情緒。