鹿茸含有多種化學成分，其中總胺基酸含量達50．13％，有甘氨酸（glycine）、賴氨酸（lysine）、精氨酸（arginine）、，天冬氨酸（asparticacid）、谷氨酸（glutamicacid），脯氨酸（proine）、丙氨酸（alanine）、亮氨酸（leucine）等17種以上。Hattori等人對鹿茸的抑制MAO活性成分進行分離，從乙醚萃取物中得了9種化合物：①膽甾醇肉豆宏酸酯（cholesterylcyristate）。②肥甾醇油酸酯（cholesteryloleate）。③膽甾醇棕潤酸酯（cndestededwhtate）。④膽甾醇硬脂酸酯（cholesterylstearate）。⑤對一羥基苯甲醛（p－hydroxybenzaldehyde）。⑥膽甾醇（cholesterol）。⑦膽甾5－烯－3B－醇－酮（cholest－5－en－3βol－one）。⑧膽甾－5－烯－3β，7α－二醇（cholest－5－en－3β，7α－diol）。⑨膽甾5－烯－β，7β－二醇（cholest－5－en－3β，7β－diol）。
從正丁醇提取物中得到尿嘧啶（uracil）。次黃嘌呤（hypoxanthine）、尿素（urea）、尿嘧啶核苷（uridine）、菸鹼酸（nicotinic acid）、肌酸酐（creatinine），其中次黃嘌呤具有抑制MAO－B活性的作用。另外，從乙醚萃取液中還分離得脂肪酸（fatty acid）、三酸甘油酯（triglycerides）和單酸甘油酯（monoglyceride），其中脂肪酸由月桂酸（lauric acid）、肉豆蔻酸（myristic acid）、棕擱酸（palmitic acid）、棕桐油酸（palmitoleic acid）、油酸（Leic acid）和亞麻油酸（linotic acid）組成，另外二種化合物沒有做進一步研究。
鹿茸中多胺類[亞精胺（spermidine）、精胺（spermine）、腐胺（putrescine）]對化合物是刺激核酸和蛋白質合成的有效成分。鹿茸尖部多胺含量較高，在亞精胺、精胺及腐胺中，以亞精胺的含量最富，鹿茸的中部和根部隨骨化程度的增強，亞精胺含量逐漸減少，而腐胺和精胺含量逐漸增加，在整個鹿茸中，由於尖部所佔重量百分比較少，所以整個鹿茸總多胺中腐胺含量最多，亞精胺次之，精胺最少。此外，鹿茸中尚含有硫酸軟骨素A等酸性多醣類物質、雌酮（esrone）、神經髓鞘磷脂（sphingomyeline）、神經節苷酯（ganglioside）、雌二醇（estradiol）、前列腺素PGE1、前列腺素PGE2、前列腺素PGF1a、前列腺素PGF1B，神經醯胺（ceramide）及鈣、磷、鎂等20種元素。